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人參完整基因組發(fā)布

2024-05-15 09:19來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 編輯:魏梓濠

5月13日,記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,該院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)生物轉(zhuǎn)錄組與代謝組創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)表了國(guó)際首個(gè)人參端粒到端粒完整基因組,并解析了人參重要活性成分三萜皂苷的形成機(jī)制。相關(guān)研究成果日前發(fā)表于國(guó)際期刊《園藝研究》。

人參被譽(yù)為“百草之王”,具有重要藥用價(jià)值。三萜皂苷是其主要活性成分之一,對(duì)中樞系統(tǒng)和心腦血管具有顯著保護(hù)作用。論文通訊作者、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員李偉告訴記者,人參屬于遺傳背景極其復(fù)雜的異源四倍體。研究團(tuán)隊(duì)綜合應(yīng)用多種測(cè)序技術(shù),成功構(gòu)建了完整性高達(dá)99.3%的人參全基因組。此外,研究人員精確鑒定了48個(gè)端粒,并預(yù)測(cè)了24個(gè)著絲粒,顯著提高了人參基因組的連續(xù)性、完整性和精確度。

基于已構(gòu)建的高完整性人參基因組,研究人員對(duì)人參三萜皂苷合成基因在異源四倍體形成過(guò)程中的不平衡進(jìn)化進(jìn)行了深入探索。研究發(fā)現(xiàn),串聯(lián)重復(fù)和近端重復(fù)在人參三萜皂苷的生物合成過(guò)程中扮演了至關(guān)重要的角色。同時(shí),在人參中有一個(gè)亞基因組的基因比另一個(gè)亞基因組的基因更為活躍,存在亞基因組優(yōu)勢(shì)現(xiàn)象。

“該研究為人參的遺傳研究、育種規(guī)劃,篩選優(yōu)質(zhì)人參種質(zhì)資源,以及探索三萜皂苷的生物合成路徑奠定了理論基礎(chǔ)?!崩顐フf(shuō)。(馬愛(ài)平)